Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrcpO35427 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrcpO35427 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CrcpO35427 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms