Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppef2O35385 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms