Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr3O09116 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms