Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MttpO08601 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MttpO08601 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MttpO08601 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MttpO08601 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MttpO08601 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MttpO08601 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MttpO08601 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MttpO08601 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MttpO08601 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MttpO08601 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MttpO08601 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MttpO08601 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MttpO08601 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MttpO08601 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MttpO08601 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MttpO08601 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MttpO08601 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms