Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E030018B13RikJ3QMS9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms