Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700014D04RikJ3QMS2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700014D04RikJ3QMS2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700014D04RikJ3QMS2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms