Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm3336J3QMQ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3336J3QMQ6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3336J3QMQ6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms