Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casp16-psI6L890 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp16-psI6L890 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp16-psI6L890 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms