Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tubgcp6G5E8P0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tubgcp6G5E8P0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubgcp6G5E8P0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubgcp6G5E8P0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms