Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933406M09RikG3XA12 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933406M09RikG3XA12 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933406M09RikG3XA12 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933406M09RikG3XA12 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933406M09RikG3XA12 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933406M09RikG3XA12 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933406M09RikG3XA12 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms