Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Arfgef1G3X9K3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfgef1G3X9K3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms