Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Farp1F8VPU2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Farp1F8VPU2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Farp1F8VPU2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Farp1F8VPU2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Farp1F8VPU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms