Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc37F8VPK0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc37F8VPK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc37F8VPK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc37F8VPK0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc37F8VPK0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc37F8VPK0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttc37F8VPK0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms