Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20538F6Z9R1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms