Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm29094F6Q785 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms