Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3460E9QAI8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3460E9QAI8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms