Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph10bE9PYQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph10bE9PYQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms