Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gimd1E9PW74 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms