Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc144bE9PVZ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms