Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clca3bE9PUL3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clca3bE9PUL3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms