Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930558K02RikE0CXC6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930558K02RikE0CXC6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms