Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930455H04RikD3Z622 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930455H04RikD3Z622 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930455H04RikD3Z622 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms