Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
3425401B19RikD3Z1D3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
3425401B19RikD3Z1D3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms