Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptprz1B9EKR1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms