Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cttnbp2B9EJA2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cttnbp2B9EJA2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms