Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1bB9EJ57 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms