Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11bB4XVQ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Phf11bB4XVQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Phf11bB4XVQ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11bB4XVQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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