Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc11B2RXC1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms