Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms