Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cfap58B2RW38 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap58B2RW38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms