Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud7bB2RUR8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud7bB2RUR8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud7bB2RUR8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Otud7bB2RUR8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.7 ms