Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms