Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms