Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grik3B1AS29 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms