Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp36B1AQJ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp36B1AQJ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms