Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M5A7VMS3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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