Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint3A7TZF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint3A7TZF0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint3A7TZF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms