Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms