Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htra4A2RT60 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htra4A2RT60 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms