Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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