Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtf1A2AQ19 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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