Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhox3fA2ANE1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox3fA2ANE1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox3fA2ANE1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms