Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec16aA2AIX1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec16aA2AIX1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms