Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VirmaA2AIV2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VirmaA2AIV2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms