Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc163A2AGD7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms