Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem185aA2AF53 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem185aA2AF53 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms