Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Krtap1-3A2A588 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-3A2A588 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms