Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6268A2A3U9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms