Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms