Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Npy2r-204ENSMUST00000182831 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gnl3l-201ENSMUST00000026297 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Wdhd1-202ENSMUST00000111792 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 L3mbtl2-204ENSMUST00000172748 3368 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dhx35-201ENSMUST00000029186 3212 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Wasf1-201ENSMUST00000019975 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Neu3-201ENSMUST00000036331 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm40999-201ENSMUST00000222586 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dclre1c-203ENSMUST00000102988 2469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms